单细胞基因组测序

产品介绍常见问题经典案例


单细胞基因组测序

产品介绍常见问题经典案例


先进的技术,大有用武之地

单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序,
解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,
为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,
为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

单细胞测序可针对性揭示单个细胞整体水平的基因信息,解决了细胞异质性难题。
可最真实的获得单克隆细胞的具体突变来源及精准的突变频率,
用来研究疾病以及癌症发生发展机制等。

Single cell 全基因组/外显子组测序
癌症基因组学 疾病基因组学
标准信息分析A 标准信息分析A+ 标准信息分析Pro

去除接头污染序列及低质量数
据比对,产出数据统计SNP检
测、注释和统计InDel检测、注
释和统计CNV检测、注释和统
计(仅全基因组测序)SV检
测、注释和统计(仅全基因组
测序)

1. 数据质控:去除接头污染和
低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计
测序深度及覆盖度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检测、注释及统计(肿瘤成
对样本)

1. 数据质控:去除接头污染和低质量
数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序深
度及覆盖度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检
测、注释及统计(肿瘤成对样本)
4. 单细胞Germline SNP聚类分析
5. PAC(主成分)分析
6. Heatmap展示图(somatic
SNV)
7. 高频突变分析(>2对样本)
  7.1高频突变基因统计
  7.2高频突变基因富集分析
8. NMF突变特征/突变频谱分析
  8.1突变频谱分析
  8.2NMF突变特征分析(>2对样
本)
9. NovoDriver已知驱动基因筛选
10. 基因组变异Circos图展示

1. 样本间协同性分析(肿瘤单细胞样
本数量≥2,且必须有组织样本)
2. MRT高频突变基因相关性分析(>
2对样本)
  2.1高频突变基因协同作用分析
  2.2高频突变基因互斥作用分析
3. OncodriveCLUST驱动基因预测
(>2对样本)
4. 突变位点分布情况分析
  4.1高频突变基因SNV/InDel突变
位点展示
  4.2预测驱动基因SNV/InDel突变
位点展示
5. 高频CNV分析
  5.1 CNV分布分析
  5.2 CNV重现性分析(>2对样
本)
6. 杂合性缺失(LOH)分析
7. LOF蛋白功能缺失分析
8. NovoDrug高频突变基因靶向用药
预测
9. NovoDR耐药突变筛选
10. NovoNoncoding非编码区高频
突变分析(单细胞外显子测序仅不包
括此分析)

* 定制化信息分析,可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

基因组测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节,助力科学研究

采用国际认可的全基因组扩增技术

多次退火环状循环扩增技术
(Multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC),具有低偏倚性。

定制化信息分析

针对不同项目,除了进行标准信息分析外,通过与合作伙伴共同探讨,制定可行的个性化信息分析方案,整合各种主流软件,优化分析结果,以确保结果的准确性及创新性。

丰富的项目经验

诺禾致源已成功完成单精子全基因组测序、单细胞转录组测序等,相关研究成果在Science、 Nature等顶级科学期刊发表。