建库测序服务

产品介绍常见问题经典案例结果展示


结果展示

建库流程

DNA样品检测合格后,使用Covaris超声波破碎仪随机打断,再经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完 成整个文库制备工作。

测序质量分布检查

测序质量说明了测序错误率的多少,测序错误率越低表明测序质量较高。

测序错误率分布检查

测序错误率是影响碱基测序质量的因素之一。根据Illumina测序平台的技术特点,测序片段(reads)前端几个bp以及片段末端的错误率会偏高。

GC含量分布检查

GC含量分布检查用于检测有无AT、GC分离现象。鉴于序列的随机性打断和G/C、A/T含量分别相等的原则,理论上每个测序循环上的GC及AT含量应分别相等,且在整个测序过程基本稳定不变,呈水平线,而N含量也反映了测序质量的好坏。

测序数据过滤

测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者 raw reads,里面含有部分带接头或低质量的reads。为了保证信息分析质量,对raw reads进行过滤,得到过滤后的数据即为clean reads,后续分析都基于clean reads。

测序数据质量汇总

测序数据质量是评估测序结果的好坏是后续数据分析的基础。

Novaseq结果展示:

Sample Raw Base(bp) Clean Base(bp) Effective Rate(%) Error Rate(%) Q30(%)
Nova001 48,489,166 48,347,720 99.71 0.03 92.59
Nova002 50,864,185 50,672,933 99.62 0.02 93.26

HiSeq Xten结果展示:

Sample Raw Base(bp) Clean Base(bp) Effective Rate(%) Error Rate(%) Q30(%)
X001-L1 24,894,052 24,670,847 99.10 0.03 92.53
X002-L5 24,010,638 23,764,677 98.98 0.03 92.80