RIP-seq

产品介绍常见问题经典案例结果展示


结果展示

与参考基因组比对

严格的比对率、比对质量、SCC分析

利用软件,将读段与参考序列进行比对,进行链相关性分析可用于检查IP的效果。

peak峰检出

反应peak的分布及序列情况

利用软件完成峰检分析(peak calling),并对峰的个数、宽度、分布等进行统计,
反应peak峰的整体分布情况,统计峰顶分布情况,模体分析(Motif search ) 。

相关基因富集分析

GO富集分析

Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系。
对相关基因做GO富集分析,差异peak相关基因相关的生物学功能,细胞组成,生物学过程。

相关基因富集分析

KEGG富集分析

在生物体内,不同基因相互协调行使其生物学功能,通过Pathway显著性富集
能确定相关基因参与的生化代谢途径和信号转导途径。