泛基因组测序

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结果展示

高级分析

挖掘特有基因

不同品种及同一品种不同个体都会有自己特有的基因,这些特有的基因
与其性状密切相关,同一作物不同品种之间的变异远比我们想象的要大。充分了解这些信息之后,
在农业研究中将有重要的价值。
通过基因组de novo 研究可充分检测到与差异性状相关的基因。

最好的变异检测


1. SNP检测

在5个大豆品种泛基因组研究中,应用泛基因组研究所检测SNP位点数量几乎是其他方法的2倍,且覆盖了绝大多数重测序所能检测到的SNP位点(>96%),变异位点准确率高达99%。

2. 快速进化区域复杂变异检测

各类栽培作物的基因组中存有大量在进化过程中受到强烈人工选择的区段,这些区段往往是快速进化的区域,传统手段难以检测。在野生品种和栽培品种间存在大量碱基变异。通过泛基因组研究,将各个品种基因组进行拼接,然后基于长序列的形式比较野生品种和栽培品种之间的变异,可全面、快速、准确的检测到变异区域,尤其是传统重测序方法检测不到的高变异区域。

3. 变异检测与农艺性状定位

高度拷贝数变异的基因多与物种农艺性状定位密切相关。大豆泛基因组研究中进行了CNV检测,鉴定出大量具有高度拷贝数变异的基因,这些基因与大豆的抗逆响应密切相关。


广泛而深入的进化研究

进化研究一直以来都是生物学家研究的热点与难点,
泛基因组研究可以从基因组水平深入探究多种进化历程与机制,例如适应性进化、趋同进化等等。
5种丽鱼科鱼基因组研究对非洲丽鱼科鱼所发生的适应性辐射以及进化机制进行了系统研究,
揭示了改变东非丽鱼科鱼基因组的一系列分子机制;并指出在纯化选择相对弱化的时期,
变异所得到的积累对于物种多样性进化可能发挥着重要作用。