人线粒体基因组测序

产品介绍常见问题经典案例


人线粒体基因组测序

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经典案例

遗传证据关于线粒体DNA异质性增加自闭症谱系障碍的致病性[1]

发表杂志:PLos Genetics
发表时间:2016.10
影响因子:6.66

本研究选用903个成三家系(患病儿童-母亲-兄弟姐妹),其中母亲和兄弟姐妹都不患病,进行线粒体测序分析,发现患病儿童的异质性突变被富集在非多态性的mtDNA位点 (P=0.0015),与多态性位点相比,该位点更可能有害。与未患病的兄弟姐妹相比,患者中含有1.5倍的非同义突变,2.2倍的致病性突变,这些突变增加了患ASD的风险,并表现为IQ 降低、社会行为障碍。研究人员进一步研究了mtDNA的异质性的传递模式是否遗传自母亲或源于自身突变。综上,该研究有助于提高ASD的诊断和治疗。

线粒体DNA与重度抑郁症之间的联系[2]

发表杂志:Current Biology
发表时间:2015.12
影响因子:8.98

前人研究表明,线粒体DNA(mtDNA)的数量会发生改变以响应外部压力,暗示了其可能与压力相关疾病重度抑郁症(MDD)相关。为探讨mtDNA的遗传调控机制,及其与MDD之 间的关联。研究使用10,442名中国汉族女性MDD患者的低覆盖度全基因组测序数据,对mtDNA水平进行了全基因组关联分析(GWAS)。以计算比对到线粒体基因组上的标准读取作 为mtDNA数量的一个衡量。结果鉴定了与mtDNA水平关联的两个位点,分别位于10号染色体的TFAM基因和7号染色体的CDK6基因,两个位点均在一个独立的阵列中复制。因此, CDK6是参与调控mtDNA的一个新分子。鉴定了MDD女性中异质性的增长率,并在利用小鼠模型的实验范式中发现,可能是由于压力造成异质性的增加。此外,研究发现至少有一个异 质性变异与mtDNA数量的变化显著相关, 暗示了位点特异性的异质性可能作为压力和mtDNA数量增加之间的联系。这些发现表明,线粒体基因组的拷贝数和序列,参与了机体对压力 的响应。

参考文献

[1] Y Wang, M Picard, Z Gu, et al. Genetic Evidence for Elevated Pathogenicity of Mitochondrial DNA Heteroplasmy in Autism Spectrum Disorder[J].Plos Genetics, 2016,12(10): e1006391.
[2]Wang Y, Picard M, Gu Z. Genetic Evidence for Elevated Pathogenicity of Mitochondrial DNA Heteroplasmy in Autism Spectrum Disorder[J]. Plos Genetics, 2016, 12(10):e1006391.