宏转录组测序

产品介绍常见问题经典案例结果展示


结果展示

De novo拼接

使用优质的拼接软件分别进行从头组装,然后对所有样品的序列进行整合并去冗余、低质量序列等,得到unigene 集合。

物种注释

mRNA与从NCBI的NR数据库中抽提出的细菌(Bacteria)、真菌(Fungi)、古菌(Archaea)和病毒(Viruses)数据进行比对,然后结合基因的表达丰度信息进行物种的注释和分类。

功能注释

CAZy(Carbohydrate-Active Enzymes Database)是研究碳水化合物酶的专业级数据库,主要涵盖6大功能类:糖苷水解酶,糖基转移酶,多糖裂合酶,碳水化合物酯酶,辅助氧化还原酶和碳水化合物结合模块。