lncRNA测序

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引领分子领域研究新热点

长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)
是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA,通过与DNA、RNA或蛋白质结合,
在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。
测序采用Illumina HiSeq平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定
和lncRNA靶基因预测,同时提供针对测序数据中mRNA的分析,
结果更全面,广泛应用于医学、农学研究领域。

精准,超值,无忧。

LncRNA的研究作为RNA研究的新领域,在生产、生活、健康方面具有重要意义,
可通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,在生产上对物种的改良,
在人类健康方面参与疾病相关的信号通路从而对疾病的发生发展及治疗有重要作用。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源lncRNA测序项目,利用六步法对lncRNA进行准确筛选,高
效预测靶基因,并完成对转录本中mRNA的分析,以及lncRNA和
mRNA的比较分析、共表达网络构建。

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lncRNA分析 mRNA分析
lncRNA拼接组装
lncRNA位点筛选
lncRNA编码潜能分析
lncRNA描述性统计
lncRNA靶基因预测
lncRNA保守性分析
ORF长度分析及exon个数分析
表达水平分析及差异表达分析
反义转录本鉴定
可变剪切分析
差异基因富集分析
TSS和TTS位点统计
SNP/InDel分析
mRNA保守性分析
ORF长度分析及exon个数分析
表达水平分析及差异表达分析
差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA取交集
lncRNA-mRNA 共表达网络构建

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

长链非编码RNA测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2015年12月,诺禾致源已经成功对牛、鼠、兔、鸡、蝴蝶、蜜蜂、线虫、沙棘、
香蕉、棉花、小等近70多个物种进行lncRNA测序分析,
并在Nature Structural & Molecular Biology等期刊发表针对人、猪、羊等物种的lncRNA研究成果。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。