eQTL

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经典案例

常见遗传变异调控人树突状细胞的病原体感染反应 [1]

发表杂志:Science
发表时间:2014.03
影响因子:37.205

通过对560个人单核细胞的分离培养,诱导单核细胞来源的树突状细胞(MoDCs),体外加药刺激建立病原体感染模型。通过对不同处理条件下eQTL分析和差异eQTL分析寻找在不同处 理情况下基因突变和基因表达差异之间的关系。最后通过eQTL分析结果和GWAS数据的联合分析,找到共同SNP位点及其影响的基因,提出通过eQTL分析可以为GWAS结果中找到的 SNP位点提供解释。

参考文献

[1] Lee MN, Ye C, Villani AC, et al. Common genetic variants modulate pathogen-sensing responses in human dendritic cells [J]. Science, 2014, 343(6175): 1246980.