BSA性状定位

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快速定位极端性状基因

BSA性状定位针对目标性状,选择表型极端差异的亲本构建家系,对该家系
目标性状表型极端的子代分别混合得到的两个样本池进行全基因组重测序,
检测到的两池间DNA差异片段即为候选区域,可进一步定位到目标性状相关的基因或标记。

周期短,定位准,性价比高。

基于全基因组重测序的BSA性状定位,可快速准确地找到差异位点,
实现目标性状基因的高效定位,具有“周期短、定位准、性价比高”的优势,
已广泛应用于水稻、拟南芥、番茄等物种。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

基于比对分析发现SNP、InDel标记,随后根据标记进行差异分析,
以获取与目标性状相关的基因。

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分析内容 解决问题
与参考基因组比对 比对率和覆盖度分析
SNP、InDel检测及注释 开发SNP、InDel标记
子代SNP、InDel频率差异分析 寻找有差异的SNP、InDel位点
目标性状区域定位 找到与目标性状关联的区域
候选基因提取和功能注释 获得候选基因及基因功能

全基因组范围挖掘性状相关位点

基于全基因组重测序技术,诺禾致源的BSA性状定位,是对整个基因组
进行测序分析,以获得全基因组范围的所有变异信息, 力争不错过任何一个与性状相关的位点。
由于简化基因组测序捕获到的基因组区域有限,若变异区域未被捕获,则与目标性状相关的基因
将不能获取,因此全基因组重测序在BSA性状定位方面具有明显的优势。

为何不能选择简化基因组BSA?>>

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

BSA性状定位采用先进的HiSeq PE150测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2015年12月,诺禾致源已成功对水稻、
拟南芥、玉米、黄瓜等几十个物种进行目标性状定位。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。