技术原理

3D数字PCR是一种基于单分子模板PCR扩增,进行核酸拷贝数精确定量的分析方法。

将样品处理分割成20000个单独的PCR反应;这些反应之中的一部分含有靶标分子(阳性),而另外的则不含靶标分子(阴性)。在经过PCR扩增和信号分析后,根据阴性反应的比例对样品中的靶标分子数目进行绝对计数,而不必参照标准品或内源性对照。

技术优势
实验流程

实验全程通过密封芯片隔绝任何污染物,无需转移步骤,避免样品暴露

检测内容

检测基因

检测位点

耐受药物

敏感药物

临床意义

EGFR

T790M

第一代EGFR TKIs:吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼

第三代EGFR TKIs:Osimertinib(AZD9291)/ Rociletinib

基因变异信息指导EGFR TKIs用药

QuantStudio® 3D Digital PCR System

固相封闭系统、检测稳定、通量灵活、维护方便、性价比高优于同类型的三代PCR平台,成为分子病理检测的新选择、

 

3D数字PCR

液滴数字PCR

ARMS-PCR

PCR反应原理

三代PCR反应,基于单分子模板PCR扩增

三代PCR反应,基于单分子模板PCR扩增

二代PCR反应,基于扩增阻滞突变系统的普通荧光PCR扩增

他液反应载体

固体芯片

乳化液滴

不对反应体系分割

液滴/体系稳定性

固相封闭系统稳定好

液滴稳定性差

/

结果分析

无需参照内源对照和标准品,直接给出目标分子拷贝数

无需参照内源对照和标准品,直接给了目标分子拷贝数

需内,外源对照,只能给出定性结果

灵敏度

0.01%

0.01%

1%

可检测变异类型

SNV,indel,CNV,fusion

SNV,indel,CNV,fusion

SNV,indel,fusion

操作过程

操作主要集中在芯片上样,其余全自动

油滴制备完成后,需要反板封膜等操作

更多手工操作,人为误差对结果影响大

通量

通量灵活
1-24个test

适合高通量
8x(1-12)个test

通量灵活
1-94个test

仪器维护

定期样准光程

定期校准光程,定期检控乳滴了生器管道是否顺畅

定期校准光程